昆明注册有机农业科技公司的流程及费用主要包括以下几个步骤：
1. 公司类型选择：根据经营需要，可以选择有限责任公司、股份有限公司等适合的公司类型。
2. 公司名称选择：选择公司名称需要符合相关规定，不得违反法律法规和社会公共利益，同时要注意与已有注册名称的差异。
3. 准备材料：准备公司注册所需的材料，包括法定代表人身份证明、股东身份证明、公司章程、注册资本等。
4. 工商登记：提交相关材料到当地工商行政管理部门进行工商登记，申请公司营业执照。
5. 税务登记：在工商登记完成后，到当地税务部门进行税务登记，办理税务登记证。
6. 开设银行账户：准备公司营业执照、税务登记证等材料，到银行开设公司银行账户。
7. 办理组织机构代码证：根据需要，申请组织机构代码证。
8. 相关许可证申请：如果经营有机农业科技相关业务需要特殊许可证件，如有机认证证书、农药经营许可证等，应按照要求逐一申请。
费用方面，注册有机农业科技公司的费用主要包括以下几个方面：
1. 注册资本：根据公司类型和经营规模的不同，注册资本的数额也会有所不同。注册资本是公司注册过程中需要缴纳的一笔费用。
2. 工商登记费用：进行工商登记时，需要缴纳一定的工商登记费用，具体费用根据当地的收费标准而定。
3. 税务登记费用：税务登记时，需要缴纳一定的税务登记费用，具体费用也根据当地的收费标准而定。
4. 许可证申请费用：如果申请特殊许可证件，如有机认证证书、农药经营许可证等，还需要缴纳相应的申请费用。
需要注意的是，具体的流程和费用可能会因地区和个人情况而有所不同，建议在具体办理过程中咨询当地有关部门或专业机构，以确保准确性和及时性。
